USA近日計劃整頓和削減國立衛(wèi)生研究院（NIH）負(fù)責(zé)支撐的5個模型生物數(shù)據(jù)庫的經(jīng)費。這一提議遭到研究人員的強(qiáng)烈反對。
46位研究人員簽署的公開信提到，這些數(shù)據(jù)庫收納了出芽酵母、蒼蠅、蛔蟲、斑馬魚和老鼠等物種的豐富數(shù)據(jù)，以促進(jìn)生物學(xué)和人類疾病研究發(fā)展。數(shù)據(jù)庫還包含了模型生物體遺傳和生物學(xué)信息，例如基因、蛋白質(zhì)、基因表達(dá)等數(shù)據(jù)。另外，數(shù)據(jù)庫也納入了分析工具信息。
“NIH在過去20年里對模型生物數(shù)據(jù)庫的支持促進(jìn)了一系列重要發(fā)現(xiàn)的產(chǎn)生。我們希望它能繼續(xù)保持這一遠(yuǎn)見卓識，支持重要的研究基礎(chǔ)設(shè)施。”研究人員在這封提交給NIH院長Francis Collins的信中提到。
今年5月，美國國家人類基因組研究所（NHGRI）官員表示，該機(jī)構(gòu)計劃逐步削減上述數(shù)據(jù)庫的經(jīng)費，在明年年初減幅達(dá)30%~40%。NHGRI在本財年為5個數(shù)據(jù)庫劃撥了1760萬美元經(jīng)費。
據(jù)悉，NHGRI正希望從NIH其他研究所獲得經(jīng)費，幫助運營這些數(shù)據(jù)庫。此外，在馬里蘭州舉行的一次會議上，NHGRI官員提出要求數(shù)據(jù)庫主要負(fù)責(zé)人在數(shù)月內(nèi)提交整合計劃，以合并這些數(shù)據(jù)庫的某些特征。在未來幾年，該機(jī)構(gòu)計劃*合并這些數(shù)據(jù)庫。
“我知道研究界存在許多擔(dān)憂，但我們需要更廣泛的支持，以便將數(shù)據(jù)庫建設(shè)得更好。目前，我們已經(jīng)無法負(fù)擔(dān)這項工作。”NHGRI計算基因組學(xué)和數(shù)據(jù)科學(xué)項目負(fù)責(zé)人Valentina Di Francesco說。她還表示，每個數(shù)據(jù)庫獨立運營會讓用戶感到混亂。“用戶應(yīng)該能用一個界面提取所有需要的數(shù)據(jù)。”Di Francesco說。
但也有人表示反對。加州大學(xué)伯克利分校發(fā)育生物學(xué)家David Bilder提出，每個數(shù)據(jù)庫包含一些特征，無法在其他地方復(fù)制。“我們并不反對融合，但呼吁整個工作應(yīng)經(jīng)過深思熟慮，以保證數(shù)據(jù)庫的高質(zhì)量和實用性。”他說。（張章）
《中國科學(xué)報》 (2016-06-30 第3版 )
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